各分支机构按成立时间，具体包括全球水伙伴（中国福建）、中国水资源战略研究会地下水工作委员会暨全球水伙伴（中国河北）、全球水伙伴（中国陕西）、全球水伙伴（中国黄河）、中国水资源战略研究会水权水市场专业委员会暨全球水伙伴（中国湖南）、中国水资源战略研究会长江分会暨全球水伙伴（中国长江）、中国水资源战略研究会“一带一路”工作委员会、中国水资源战略研究会海洋专业委员会和中国水资源战略研究会流域碳中和专业委员会。
中国水资源战略研究会地下水工作委员会暨全球水伙伴（中国河北）
中国水资源战略研究会水权水市场专业委员会暨全球水伙伴（中国湖南）
中国水资源战略研究会长江分会暨全球水伙伴（中国长江）
中国水资源战略研究会“一带一路”工作委员会
中国水资源战略研究会海洋专业委员会